A história é centrada em torno de filho de Alan Jetro ("Jet", Bradley. Como os eventos do filme, ENCOM foi retomado por uma empresa chamada Future Control Industries (FCON). Depois de falar com seu pai, que é seqüestrado enquanto no telefone com o Jet, Jet é digitalizado por Ma3a, sistema de Alan computador AI, para ajudá-la no combate Thorne, a corrupção se espalhando por todo o sistema do computador. Jet-se rapidamente, e equivocadamente, identificado como a fonte da corrupção, e é capturado pelo núcleo, o programa de controle de sistemas de segurança.
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